Deutscher MeSH - bilinguale Fassung

Der Thesaurus biomedizinischer Fachbegriffe MeSH wird im englischen Original jährlich von der U.S. National Library of Medicine (NLM) herausgegeben.
ZB MED gibt die deutsche/bilinguale Fassung heraus und veröffentlicht sie zum kostenlosen Download im PUBLISSO Fachrepositorium Lebenswissenschaften (FRL). Neben der jeweils jahresaktuellen Version werden auch die einzelnen Versionen ab Version 25.0. von 2020 bereitgestellt.

Die Deutschen MeSH werden in 6 unterschiedlichen Formaten veröffentlicht:

• CSV: Das Format ist für den Import in relationale Datenbanksysteme geeignet.
• XML: Der Gesamtbestand des MeSH in der Datei ist groß und kann nur mit XML-fähiger Software sinnvoll bearbeitet werden.
• RDF/XML: Die Dateigröße ist deutlich größer als das XML und ist für den Import in (RDF-)Graphdatenbanken geeignet. Als Identifikatoren werden hier Internationalized Resource Identifier (IRI) verwendet. Dadurch sind die Identifikatoren semantisch, maschinenlesbar und FAIR. Das Format kann zum Beispiel mit der Software Protégé bearbeitet werden. Es ist geeignet, um es in Terminologieserver zu laden.
• Turtle: Die Dateigröße ist deutlich größer als das XML. Als Identifikatoren werden hier Internationalized Resource Identifier (IRI) verwendet. Dadurch sind die Identifikatoren semantisch, maschinenlesbar und FAIR. Dies ist analog zum RDF/XML-Format, allerdings ist die Struktur für den Menschen einfacher lesbar.
• N-Triples: Die Datei ist analog zu den Formaten RDF/XML und Turtle sehr groß und kann nur mit RDF/XML-fähiger Software sinnvoll bearbeitet werden. Eine N-Triples(.nt) Datei ist ein zeilenbasiertes, reines Text-Serialisierungsformat für RDF-Graphen. Dieses Format wird in einer reinen englischen Version auch vom NLM angeboten.
• JSON-LD: Die Dateigröße ist deutlich größer als das XML und für den Import in NoSQL-Datenbanken - bevorzugt JSON basiert - geeignet. Als Identifier werden ebenfalls Internationalized Resource Identifier (IRI) verwendet. Dadurch sind die Identifikatoren semantisch, maschinenlesbar und FAIR. Das Format kann zum Beispiel in eine GraphDB oder MongoDB importiert werden.

Für die Nutzung der deutschen MeSH-Terms gilt, unter Beachtung der Nutzungsbedingungen der NLM, die CC BY 4.0-Lizenz.